超音速导弹对海上目标威胁极大。就拿南部战区演训中的鹰击 - 12来说，末端突防速度达4至5马赫，射程约四五百公里。采用掠海飞行时，舰载雷达最大探测距离仅20至30公里，从发现到被击中，留给防御方的反应时间不足30秒，这和亚音速导弹比起来，反应窗口被极大压缩。
现有主流舰载防空体系也有短板，像美军宙斯盾系统的“改进型海麻雀”，远程拦截有明显缺陷。而飞行在“临近空间”的高超音速导弹，还能钻进防空反导体系的拦截盲区。还有俄罗斯的“匕首”导弹，能攻击航母等大型舰艇，海上目标在它面前着实危险。 同时，超音速导弹的威力也不容小觑。以鹰击 - 12为例，其携带的高爆战斗部，一旦命中海上目标，足以撕开舰船的厚重装甲，引发内部爆炸和火灾，瘫痪舰船的战斗力。而且，多枚超音速导弹同时发动饱和攻击时，更是让海上目标的防御系统顾此失彼。
在现代海战场景中，拥有超音速导弹的一方就如同握有一把锋利的剑。敌方舰队在面对这种威胁时，如同身处布满陷阱的战场，时刻面临被突破防线的风险。即使是强大如航母战斗群，虽然有多层防御体系，但在超音速导弹的高速突防和强大威力面前，也不敢掉以轻心。
随着军事科技的不断发展，超音速导弹的性能还会不断提升，其对海上目标的威胁也会持续增大。未来海战中，如何有效防御超音速导弹的攻击，将是各国海军亟待解决的重要课题，否则海上目标在超音速导弹面前将始终暴露在危险之下。