毛人凤逃往台湾后密谋绑架蒋经国，引发蒋介石大怒，最终他58岁郁郁而终死于癌症
1946年春末，南京国防部情报例会刚散，几名军统骨干蹙着眉头在走廊里低声议论——戴笠的遗像还挂在墙上，谁来填补那道真空成了悬案。毛人凤当时只是副手，却迅速意识到，握住“机要人事”就等于握住命脉。短短数月，他把档案室、密码股、特训班一并揽到手里，表面谦卑，实则步步为营。
保密局正式挂牌同年秋天，郑介民是名义上的局长，蒋介石如此安排是想让高层权力保持平衡。然而局里真正的话语权，却在毛人凤暗中编织的“关系网”里流动：晋升、调任、津贴，都要经过他的句点。有人揶揄说，“毛局的电话线，比上海租界的电线还密。”

1949年底，战局崩溃，军统系统仓促渡海。1950年2月，在基隆码头吹着冷风的毛人凤没料到，迎接他的不是鲜花，而是蒋经国带来的“重整方案”。蒋经国自称只改三个方面：档案、编制、培训。实质上，每一条都削去毛的羽翼。干训班在阳明山开课第一天，蒋经国拍着桌子说：“情报工作最怕旧习气，这里没有资历，只有成绩。”毛人凤坐在后排，脸色沉如薄暮。

蒋经国的手术刀先割人事。叶翔之贪腐案原本是毛人凤准备的杀手锏，以为可以一棍敲掉对手。档案交上去后，蒋经国却保住叶翔之，并把案卷锁进保险柜。毛人凤暗叹失算，却只能佯装配合。回到住处，他对心腹咬牙低语：“再这样下去，连门牌都要被他换掉。”心腹问：“那怎么办？”他冷笑：“等机会。”
1953年冬夜，机会在酒桌上浮现。杜长城自请“办一票大的”，声称只要控制蒋经国半日，所有布局都能翻盘。毛人凤沉吟许久，吐出一句：“成与不成，只此一回。”两人草拟计划，资金来源是杜长城走私的黄金。次年春，海关截获黄金，线索直指杜长城；军法处锁死审讯室门，杜长城一夜供出全部细节。枪声响在清晨六点，蒋介石的批示三字——“速处决”。

宋美龄闻讯后只做了一件事：把毛人凤的名字从公审名单里划掉。活下来的人却已成光杆司令。1954年底，保密局改名“军情局”，局长两字停留在文件封面，实权则归入蒋经国新设的联勤情报处。毛人凤再想发力，只剩“特案”一条路。1955年，他递上“斩首大陆领导人”计划，蒋介石口头批准，却要求“绝不连累国际”。计划在香港露了马脚，英美媒体大篇报道，蒋介石当晚召见毛人凤，仅说一句：“此后不许擅自行动。”那一夜，毛人凤回到寓所，独坐到天亮，烟灰铺满茶几。
长期的挫败让他胃口尽失。1956年春，台北马偕医院切片结果显示：肝癌晚期。家人陪他飞赴旧金山手术，主刀医生私下感叹：“病灶多处转移，恐难回天。”回台后，他住进三军总医院，桌上放着一本旧军统花名册，名字旁的批注歪歪斜斜——“生”“死”“去职”。7月的一个午后，他把笔掷向墙角，自嘲一句：“原来我也是被批注的那一个。”

10月14日清晨，他在微弱氧气声中离世，终年58岁。讣告用的是最朴素的格式：中华民国陆军中将、前保密局局长毛人凤病逝。四天后，蒋经国主持情报系统例会，开场白只有一句：“过去的事情，就让它过去，工作继续。”室内一片低应，窗外松涛无声，却宣告旧军统时代彻底落幕。